Selected Cell
Cell:
Value:
RNAinVAL_Ecoli_ds_production
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| pool | MasterMix used: | MasterMix used: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| amplikon | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | Roche Probes Master with ROX | SYBR Power Abi | |||||||||
| 16S TaqMan | A | vz1 (Ecoli_dsGFP) 100x | vz1 1000x | vz1 10 000x | vz2 (Ecoli_dsMesh) 100x | vz2 1000x | vz2 10 000x | vz3 (dsMesh K) 100x | vz3 1000x | vz3 10 000x | 100 | 100 | 1000 | 1000 | 10 000 | 10 000 | |||||||||||||||||||
| B | 100 000 | 100 000 | 1mio | 1mio | NTC | NTC | 16S Taqman | SYBR | |||||||||||||||||||||||||||
| mesh_SYBR | C | vz2 (Ecoli_dsMesh) 100x | vz2 1000x | vz2 10 000x | vz3 (dsMesh K) 100x | vz3 1000x | vz3 10 000x | 100 | 100 | 1000 | 1000 | 10 000 | 10 000 | vzorcev/amplikon: | 3 | 2 | |||||||||||||||||||
| D | 100 000 | 100 000 | 1mio | 1mio | NTC | NTC | lukenj/vz: | 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||
| GFP_SYBR | E | vz1 (Ecoli_dsGFP) 100x | vz2 1000x | vz2 10 000x | 100 | 100 | 1000 | 1000 | 10 000 | 10 000 | NTC, umeritvena: | 12 | 12 | ||||||||||||||||||||||
| F | 100 000 | 100 000 | 1mio | 1mio | NTC | NTC | procent izgub: | 10 | % | 10 | % | ||||||||||||||||||||||||
| G | št. reakcij z upoštevano izgubo: | 33 | 26.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| J | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | TaqMan amplikoni | SybrGreen amplikoni | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| N | št. reakcij: | 33 | št. reakcij: | 27 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| O | sonda: | 150 | 0.075 | sonda: | |||||||||||||||||||||||||||||||
| P | FP: | 300 | 0.05 | FP: | 300 | 0.05 | |||||||||||||||||||||||||||||
| RP: | 300 | 0.05 | RP: | 300 | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 1) | za vzorce pripraviti redčine: 10x, 100x, 1000x, 10.000x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2) | PRIPRAVITI POOL vz 1 in 2 (100x = 2ul + 198ul H2O) | MIX for each amplicon | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3) | pool redčit iz 100x, 1000x, 10 000x, 100 000x, 1 miox | UMM (2x) | 82.5 | ul | UMM (2x) | 67.5 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||
| FP | 1.6500000000000001 | ul | FP | 1.35 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | 1.6500000000000001 | ul | RP | 1.35 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| sonda | 2.475 | ul | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| ddH2O | 10.724999999999994 | ul | ddH2O | 10.800000000000011 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| vzorci | 66 | vzorci | 54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| skupaj mixa | 99 | ul | skupaj mixa | 81 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| pipetiramo | 3 | ul | pipetiramo | 3 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| skupaj Mix+Vz | 165 | ul | skupaj Mix+Vz | 135 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ostane mixa | 9 | ul | ostane mixa | 9 | ul | ||||||||||||||||||||||||||||||
| primerji: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stock | Delovne raztopine za 5 ul reakcije: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primerji | priprava | uM | ul v mix | V reakcije | konc/reakcijo | nM | |||||||||||||||||||||||||||||
| 100 uM | 30 uM | 30+70 | 30 | 0.15 | 5 | 0.9 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 30 | 0.09999999999999999 | 5 | 0.6 | 599.9999999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 30 | 0.049999999999999996 | 5 | 0.3 | 299.99999999999994 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Sonda | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 100 uM | 10 uM | 10+90 | 10 | 0.125 | 5 | 0.25 | 250 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 10 | 0.075 | 5 | 0.15 | 150 |
